La formation ENSEM sous statut apprenti (FISA) ne suit pas tout à fait la même organisation du fait des rythmes d’alternance d’environ un mois à l’école et un mois en entreprise (62 semaines en école et 79 en entreprise).
Les contenus de formation sont plus généralistes que pour le diplôme FISE, ce qui se traduit par un tronc commun étendu aux deux premières années de formation (au lieu de trois semestres en FISE). Les contenus pédagogiques restent identiques même si, en FISA, l’organisation en UE ne suit pas la même logique que celle appliquée en FISE afin de favoriser la compensation entre disciplines pour des élèves ayant des profils très diversifiés selon leur parcours de formation précédant l’entrée à l’école.
A partir du semestre 9, les élèves FISA retrouvent la logique de choix de blocs de compétences mutualisés avec la formation FISE même si, compte tenu des rythmes d’alternance, le choix est plus réduit et les enseignements de tronc commun plus nombreux. Les entreprises accueillant les apprentis sont bien sûr consultées pour le choix des blocs réalisés par les élèves. La formation en entreprise est focalisée sur les mises en situation professionnelle ainsi que sur les compétences générales de l’ingénieur (compétences méthodologiques et relationnelles, gestion…).